Bandeau AgroDiv

Intégration de données multi-omiques appariées à grande échelle.

Thèse intégrée au projet AgroDiv, encadrée par INRAE.

  • Titre : « Intégration de données multi-omiques appariées à grande échelle », INRAE.
  • Doctorant : Jeong Ko.
  • Unité de rattachement : INRAE, UMR 0875 - MIA-T – SaAB.
  • Co-encadrement :
    • Nathalie Villa-Vialaneix (INRAE) ;
    • Andrea Rau (INRAE).
  • École doctorale : Ecole doctorale Mathématiques, informatique et télécommunications.
  • Durée du projet : 2023 - 2026.

Résumé du projet :

Ce projet de thèse se propose de développer des méthodes d'analyse statistique pour explorer la diversité génétique inter-espèces. De manière plus précise, il s'inscrit dans le cadre du projet AgroDiv (PEPR Agroécologie et Numérique) qui ambitionne une caractérisation fine de la variabilité génétique sur la base d'une collection étendue d'espèces botaniques et animales qui pourraient présenter un intérêt pour l'agriculture, particulièrement dans un contexte de mutation environnementale forte et de changement climatique. Dans ce cadre, ce travail de thèse visera la mise au point de méthodes d'intégration de données omiques pour explorer les relations entre marques génétiques d'intérpêt et signaux transcriptomiques et épigénétiques. Ces méthodes seront la base pour la définition de relations spécifiques à une espèce donnée ou, au contraire, conservées entre espèces et permettront une meilleure caractérisation de la variabilité des phénomènes de régulation dans une race donnée.

Voir aussi

Date de modification : 20 août 2024 | Date de création : 02 avril 2024 | Rédaction : AgroEcoNum